商业秘密深度保护方法从商业秘密泄密风险的三要素入手，采用定量或定性的分析方法，确定泄密风险的大小，并采取有效的风险处置方式和控制措施，将泄密风险控制到允许的范围，从而保护商业秘密的安全。商业秘密深度保护方法具有保护范围广泛、控制严密、保护效果好、实施周期长等特点，需要企业有严密的组织架构、充分的人力资源和技术能力，适合商业秘密数量较多、商业秘密保护要求较高、管理规范的大型企业。